公路运输是呼伦贝尔市境内的重要运输方式，现有公路109条，公路里程8163公里，其中：国省干线里程2592公里，边防线里程2163公里，县乡道里程3408公里。
呼伦贝尔市公路交通事业，已形成了以海拉尔、那吉镇为枢纽，以国道111线北京-加格达奇，国道301线绥芬河-满洲里，及省道黑河-黑山头、拉布大林-阿木古郎、满洲里-阿拉坦额莫勒等国省干线公路为骨架，以县乡、边防、专用公路为脉络的公路交通网。
国家主干线301线，与滨洲铁路平行，穿越大兴安岭，横跨呼伦贝尔草原，是呼伦贝尔市的经济建设大动脉，同时也承担着对外贸易的运输任务。
全市现有营运车辆21786辆，班线客车777辆，货车11161辆，年完成货运量2670万吨，货运周转量120050万吨公里，客运量1937万人次，客运周转量110088万人公里。现有长途客运班线178条，跨省区9条，跨盟市3条。日发班次648个，日送旅客1.2-1.5万人次，站点652个，乡镇（苏木)通车率94.2%，村(嘎查)通车率85.1%。
全市现有公路(水路)口岸7个，其中一类口岸4个，二类口岸3个，设立了满洲里、黑山头、室韦、阿日哈沙特、额布都格口岸国际汽车站。
呼伦贝尔市运输管理总站，下辖15个旗市运输管理站，30个运输管理分站，负责国家、自治区有关道路运输方针、政策、法规的贯彻实施和本地区道路运输行业管理工作；涉外运输管理建立了呼盟口岸运输管理办公室，与市运输管理总站合署办公。
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